A: 在审计报告日后六十天内完成审计工作底稿的归档工作
B: 在审计报告日后九十天内完成审计工作底稿的归档工作
C: 在审计报告公布日后六十天内完成审计工作底稿的归档工作
D: 在审计报告公布日后九十天内完成审计工作底稿的归档工作
【解析】选项A正确。审计工作底稿的归档期限为审计报告日后六十天内。如果注册会计师未能完成审计业务,审计工作底稿的归档期限为审计业务中止后的六十天内。