【解析】选项C正确，对自动化运行的控制，注册会计师更可能测试信息系统一般控制的运行有效性，以获取控制在剩余期间运行有效性的审计证据。选项A错误，如果通过实施实质性程序未发现某项认定存在错报，这本身并不能说明与该认定有关的控制是有效运行的。选项B错误，如果控制在剩余期间发生了变化(如信息系统、业务流程或人事管理等方面发生变动)，注册会计师需要了解并测试控制的变化对期中审计证据的影响。选项D错误，如果已获取有关控制在期中运行有效性的审计证据，并拟利用该证据，注册会计师应当确定针对剩余期间还需获取的补充审计证据。
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