正高级会计师和注册会计师是两个完全不同的概念，注册会计师是一种资格考试，正高级会计师属于职称考试，类似初级会计师、中级会计师，这是一种职称。
除此之外，正高级会计师和注册会计师的区别其实还有很多，具体区别如下：
正高级会计师的职称评定标准，每个地区有所差异，但几乎都是在高级会计职称的基础之上，从事相关工作满5年及以上，进行以同行专家评审为基础的业内评价。在评价的形式上，可能包括成果展示、面试答辩、综合评议等，所以其实在一定程度上也有一些主观色彩存在。
注册会计师要求在五年内考完《会计》、《审计》、《财务成本管理》、《经济法》、《税法》、《公司战略与风险管理》6科专业阶段的科目，之后再考综合阶段的科目《职业能力综合测试》，全部通过后即可获得注册会计师证书。并且，按照是否在会计师事务所执业，注册会计师还可以分为执业注会和非执业注会两种。
注册会计师和正高级会计师二者之间的性质是完全不一样的，正高级会计师属职称资格认定。而注册会计师属于执业资格认证，其本质是拥有在会计师事务所执业的权利，有审计的签字权。
其实从某种程度上讲，正高级会计师和注册会计师这两类人才都属于会计行业的领军人物，只不过出身不同，看上去好像会有矛盾。但是就整个行会计业的发展而言，两者都是整个体系中关键的部分，它们的发展，也会共同促进会计行业朝着健康良性的方向发展。
