北大光华管理学院在职MBA的课程设置内容丰富，核心课程包括《商务英语》、《财务会计》、《管理经济学》、《数据分析与统计决策》、《组织行为学》、《运营管理》、《世界政治经济环境中的中国》、《营销管理》、《公司财务I》、《公司财务II》、《战略管理》、《批判思维与商业伦理》、《企业社会责任》、《商业模拟与领导力反思》、《学术规范与论文写作》、《国际商务方略》。
此外，北大光华管理学院在职MBA开设了选修课程。目前，北大光华管理学院在职MBA项目的选修课体系已经形成了以金融与投资以及创新创业为核心方向，以综合管理、医疗与健康方向、文化产业方向、社会公益管理方向以及数据产业方向为特色方向的完整体系。满足这些方向的学习要求，学生提议提出申请，MBA项目会出具相应方向上的方向证明。当然，MBA学生也可以不选择任何方向，只要修满要求的选修课学分，也可以满足毕业要求。MBA学生可以根据自己的兴趣、过往的教育背景和经历以及未来职业发展规划进行选课。
北大光华管理学院在职MBA借助于北大深厚的人文底蕴、系统而创新的课程设置和丰富的课外活动，旨在使学生了解前沿的商业知识，具备跨文化的敏感性与人际沟通技能，成为具有在复杂环境下分析、解决问题的能力和勇于承担未来挑战的创新性人才。
北大光华管理学院在职MBA的学习年限为2年，经申请并获批准可延期，最长不得超过5年。必修课的学习在第一学年进行；选修课主要安排在第二年，以周末和晚上授课为主。要求所有学生在第三学期结束时，完成全部的课程学分，第四学期专门用于写论文和处理毕业相关事宜。
北大光华管理学院在职MBA要求学员需要完成45学分，其中核心课30学分，选修课（Electives）15学分。此外，还要完成毕业论文并通过论文答辩。毕业论文要求内容充实，理论联系实际，写作规范，符合学术道德。毕业论文完成后，经指导教师同意应按规定申请答辩。按照北京大学的要求，MBA学生须用简体中文撰写毕业论文。北大光华管理学院在职MBA学员在规定年限之内，学完规定的课程，成绩合格，修满学分，完成硕士学位论文并通过北京大学组织的学位论文答辩，经校长批准，颁发注明学习方式的北京大学硕士研究生毕业证书；经校学位评定委员会审查批准，授予北京大学工商管理硕士专业学位。
