税务局退的手续费做其他收益或者营业外收入科目。税务局退的手续费即个税手续费，根据《财政部、税务总局、人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》规定，“三代”单位所取得的手续费收入应单独核算，计入本单位收入。企业需要借记“银行存款”科目，贷记“其他收益”科目或“营业外收入”科目和“应交税费——应交增值税（销项税额）”科目。然后在期末企业应当借记“其他收益”科目或“营业外收入”科目，贷记“本年利润”科目。
企业代扣代缴个人所得税取得的手续费属于增值税征收范围，应按商务辅助服务-经纪代理服务征收增值税。
