开展农业专项资金审计工作，有利于各级政府和有关部门加强对农业专项资金的管理和使用，同时也促进了被审计单位对国家宏观决策的贯彻落实，切实提高了对农业、农村和农民专项业务工作的效率和工作质量。
农业专项资金审计是审计机关依法对被审计单位农业专项资金财政、财务收支活动的真实性、合法性和效益性所开展的审查监督活动，其内容主要包括审查农业专项资金的分配是否足额到位、审查农业专项资金项目的流向是否合理、审查农业专项资金计划的执行和完成情况、审查被审计单位的财务管理和内部控制制度是否健全有效以及审查农业专项资金的经济效益情况等。
