企业内部审计有效应用持续审计的建议有：
1、完善企业内部信息化环境建设。持续审计的实施，与企业的信息化程度息息相关。在企业信息化的过程中，企业的业务处理方式与审计方式都会出现变化，以适应不断变化的信息环境。因此必须建立可靠的持续审计系统、信息技术平台，实现企业整体信息化管理。
2、转变现有审计观念，提升审计师的业务技能。向企业管理层及审计师宣传持续审计的巨大收益，了解实现在线审计能够减少企业内部审计人员现场审计所需要支付的费用，改变管理层及内部审计师对持续审计的看法。持续审计需要运用高度自动化的持续审计软件，因此，内部审计人员需要具备计算机、网络审计方面的知识。
3、加强持续审计相关技术的开发。完善对持续审计系统的开发让更多企业安装完全的嵌入式的自动化持续审计应用程序，减少企业整体系统的负荷。此外，研发数据仓储技术，使得信息的检索和分析能够尽可能的灵便、开放。
4、内部审计准则应补充持续审计的内容。持续审计涉及的审计证据一般是以电子数据的形式存在，审计准则应补充网络环境下储存、传递的电子数据相关的内容，对网络报告如何发布、发布的形式、发布的格式等方面作出相应规定。
5、率先在条件成熟的集团公司试点推行。选取条件成熟的集团公司率先进行持续审计的试点应用，帮助信息化、网络化程度较高的企业改善内部审计技术，也可为我国在内部审计中广泛推行持续审计作好准备。
