减免税审计的内容主要包括：
1、征税对象的起征点、免征额的核定是否符合规定，有无擅自提高起征点和扩大免征额的问题；
2、批准减税、免税是否符合管理权限，有无超过权限批准减税、免税的问题；
3、减税、免税期限是否符合规定．有无擅自延长减税、免税期限的问题；
4、减税、免税的范围是否符合规定，有无扩大减免税税种范围的问题；
5、减税、免税的幅度是否正确，有无擅自提高减税、免税幅度的问题；
6、减税、免税批准手续是否齐全、完备，有无以报代批或口头批准减免的问题；
7、减免税款是否返还到纳税单位，有无挪用和贪污减免税款的问题。
