专项应交款是企业应由专项资金上交的各种款项，主要包括应交能源交通建设基金、应交预算调节基金等。对专项应交款进行审查时应注意各种专项应交款的内容是否合理，有无与其他应交款相混淆的情况；各种专项应交款的计算是否正确，有无多计或少计的情况；各种专项应交款的解交是否及时，有无长期拖久的情况；各种专项应交款的金额是否正常，有无账务处理不当的情况。
为了反映和监督按规定交纳的国家能源交通重点建设基金和国家预算调节基金，企业建设单位应设置“专项应交款”科目，并下设“能源交通重点建设基金”、“预算调节基金”明细科目进行核算。
