发票认证不了的原因可能是由于负责发票认证的人员将发票的数据录入错误导致，或企业业务经办人员所取得的由对方单位开具的发票属于不合规定及不属于税务机关发放的发票。若企业的发票多次认证不了时，企业的财务人员应当及时与对方单位的相关工作人员进行沟通，并要求单位作废或开具红字发票然后开具新的发票，若对方单位存在不配合重新开具的情况时，企业财务人员应当按照《中华人民共和国会计法》第十四条的内容规定，对该发票不予接受。