新疆大学工商管理硕士的学制为3年，在校学习最长年限4年。课程以课堂讲授、辅导与案例分析为主，辅以小组讨论、实战模拟以及各种课程延伸讲座和企事业单位的移动课堂等，学员能在掌握扎实理论基础的同时，提高实践能力。
新疆大学工商管理硕士分为全日制和非全日制两种学习形式，在MBA培养过程中，突出理论教学和案例诊断相结合，同时聘请一批区内外知名院校师资和企业家导师参与培养和实践指导。所培养的MBA学员大多数成长为中央驻疆企业、新疆本地国有企业及民营企业的中高层管理人员，在自治区经济社会发展人才培养方面发挥着重要的作用。
