疫情期间医保退费会计分录如下：
1、收到医保退费：
借：银行存款
贷：应付职工薪酬——医疗保险费
2、冲减以前计提的医保费：
借：应付职工薪酬——医疗保险费
贷：管理费用
企业收到医保退费时，一般情况下是直接冲减以前企业计提和缴纳的医保费用，或者计入企业营业外收入，但计入营业外收入会涉及到企业所得税，若是企业考虑节税方面，则将收到医保退费时直接冲减相应的分录。
疫情期间，中小微企业和单位形式参保的个体工商户企业养老保险、失业保险和工伤保险，其单位缴费部分免征；而大型企业及其他单位的养老保险、失业保险和工伤保险，其单位缴费部分减半征收。
