A: 一等奖奖金1万元、二等奖奖金5000元、三等奖奖金3000元
B: 一等奖奖金5000元、二等奖奖金2000元、三等奖奖金1000元
C: 一等奖奖金5万元、二等奖奖金3万元、三等奖奖金1万元
D: 一等奖奖金1万元、二等奖奖金2000元、三等奖奖金1000元
本题考核不正当有奖销售行为的规定。
根据规定,抽奖式有奖销售,最高奖的金额不超过5000元,因此选项B的设置方案是正确的。