在发行制度上，公司债采取核准制，由证监会进行审核，证监会有权决定是否准许其发行，对总体发行规模没有一定的约束。企业债采取的是审核制，由国家发改委进行审核，发改委每年会定下一定的发行额度。
企业债公司债具体区别如下：
1、发行主体区别
公司债是由股份有限公司或有限责任公司发行的债券；企业债是由中央政府部门所属机构、国有独资企业或国有控股企业发行的债券，它对发债主体的限制比公司债窄。
2、发债资金用途差别
公司债主要用途包括固定资产投资、技术更新改造、改善公司资金来源结构、调整公司资产结构、降低公司财务成本、支持公司并购和资产重组等；企业债主要限制在固定资产投资和技术革新改造方面，并与政府部门的审批项目直接相关。
3、信用来源差别
公司债的信用来源是发债公司的资产质量、经营状况、盈利水平和持续盈利能力等；而企业债不仅通过“国有”（即国有企业和国有控股企业等）机制贯彻了政府信用，而且通过行政强制落实担保机制，实际信用级别与其他政府债券大同小异。
4、发债额度差别
公司债最低限大致为1200万元和2400万元，企业债发债数额不低于10亿元。
5、管制程序差别
公司债监管机构往往要求严格债券的信用评级和发债主体的信息披露，特别重视发债后的市场监管工作；企业发债由国家发改委和国务院审批，要求银行予以担保；一旦债券发行，审批部门则不再对发债主体的信息披露和市场行为进行监管。
6、市场功能差别
公司债是各类公司获得中长期债务性资金的一个主要方式；企业债受到行政机制的严格控制，每年的发行额远低于国债、央行票据和金融债券，也明显低于股票的融资额。
