行政单位绩效审计的原则包括：
1、应遵循多样性的审计原则。
2、应采取以宏观效益、间接效益、社会效益为主的审计原则。
3、应采取讲究经济效益的审计原则。
4、应采取工作效率与管理效率并列审查的原则。
行政单位绩效审计是一项对行政单位关于相关政策的执行效果是否经济、高效的审计检查活动，通过分析行政单位有关运行活动是否在经济性、效率性、效果性等方面存在问题，以协助被审计单位作出有效的改善措施。行政单位绩效审计主要用于评价上级布置的工作任务和本单位制定的目标、社会综合效益以及本单位的经济效益和管理效率等指标。
