企业合同管理审计的方法包括：
1、项目管理式审计：是有重点、有目的地将合同管理纳入年度审计计划后形成特定的审计项目，并对其实施相应审计程序的一种审计模式；
2、过程参与式审计：是由专职内部审计人员对企业内部所签的合同实施审计审签工作，并对合同管理的部分重要过程进行监督的一种审计模式。
企业合同管理审计是审计机关及其人员对被审计单位合同管理工作的合法性、规范性和效益性，合同的签订、履行情况以及与合同相关内部控制制度建立的健全性和有效性所开展的审查监督及评价活动。
通过开展企业合同管理审计工作，有利于改善被审计单位的内部管理水平，同时可以预防和降低被审计单位的经营及管理风险。
