会计电算化系统舞弊出现的原因主要如下：
1、会计软件的缺陷。目前市场上有数百种会计软件，有些单位使用独立开发的软件，各软件水平参差不齐。一些企业使用的软件安全性与保密性上存在着诸多的问题和不足，使得舞弊者有机可乘。
2、企业内部控制制度的缺陷。实施会计电算化，需建立与之相配套的一系列内部控制制度加以约束，才能充分发挥电算化的优势。目前，不少单位无严密的管理制度或有章不循，使得会计电算化不能正常健康运转。由于内部控制制度薄弱，操作人员可能超越权限或未经授权的人员有可能通过计算机和网络浏览全部数据文件，篡改、复制、伪造、销毁企业重要的数据，以达到个人目的。
