合理损耗和其他毁损、短缺的会计处理的区别在于合理损耗一般不计入商品的实际成本，而是确认为当期的营业费用，其他毁损、短缺则一般通过“待处理财产损溢”科目进行登记并由企业决定其会计处理方式。

　　合理损耗指企业日常生产经营过程中在购进货物途中所发生的在合理预计范围内的货物的耗费损失；而其他毁损、短缺则指企业货物在运输途中因特殊原因所导致的货物非正常缺失，应用计划成本法计算货物成本的企业在通过“待处理财产损益”科目进行处理时，也应当将成本差异进行结转。