企业的失控发票被主管税务机关查明后需要补增值税,在完成增值税的缴纳后还需要按照税务机关的要求缴纳城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加。

  其中,失控发票指使用增值税发票管理系统的纳税人丢失、被盗的税控专用设备中所存在的未开具的增值税专用发票,以及列为非正常户的纳税人已开具未申报或未按规定缴纳税款的增值税专用发票。存在失控发票的企业应当及时向主管税务机关反映并解决,由税务机关按照《中华人民共和国税收征收管理法》的规定进行处理。