海关完税凭证的审核方式主要包括资金审核法、业务逻辑审核法、报关单位审核法、缴税资金审核法、海关完税凭证来源地审核法、特定栏次填开内容审核法、票面打印章戳痕迹审核法、滞纳金审核法、联次审核法、报关单纸张审核法、相关单证完整性审核法、关编码规则审核法等。

　　海关完税凭证是除了增值税专用发票以外可以用于增值税抵扣的凭证，是增值税一般纳税人取得所有需抵扣增值税进项税额的海关进口增值税专用缴款。应根据相关海关完税凭证逐票填写海关完税凭证抵扣清单，在进行增值税纳税申报时随同纳税申报表一并报送。