居民企业以非货币性资产对外投资，应对非货币性资产进行评估并按评估后的公允价值扣除计税基础后的余额，计算确认非货币性资产转让所得，故甲居民企业应当确认的非货币性资产转让所得=800-500=300万，A选项正确；居民企业以非货币资产对外投资确认的非货币性资产转让所得，可在不超过5年期限内，分期均匀计入相应年度的应纳税所得额，按规定计算缴纳企业所得税，B选项是分6年计入相应年度，超过5年的最长期限，故B选项不正确；居民企业以非货币性资产对外投资，应于投资协议生效并办理股权登记手续时，确认非货币性资产转让收入的实现，故C选项不正确；被投资企业取得非货币性资产的计税基础，应按非货币性资产的公允价值确定，乙居民企业取得生产线的计税基础应当按照其公允价值800万来确定，故D选项正确。