企业管理和会计学硕士的区别在于两者性质的不同，企业管理指对企业的生产经营进行计划、组织、指挥、协调和控制等一系列活动的总称，属于管理学的一个概念。会计学硕士指学生在完成会计学专业的教育并顺利毕业后所取得的一项学术学位。
我国国内针对不同学科都开设有不同的招生方向，部分院校也针对企业管理开设有研究生的招生渠道，以复旦大学为例，院校在工商管理学术学位硕士的招生中开设有财务学、会计学、市场营销、企业管理、东方管理与企业文化、技术经济及管理共6个研究方向，其入学初试的科目为《思想政治理论》、《英语（一）》、《数学（一）》、《微观经济学》。
