根据税收征收管理法律制度的规定，下列情形中，税务机关有权核定纳税人应纳税额的有（ ）。
A: 纳税人按照法律、行政法规的规定应当设置但未设置账簿的
B: 纳税人虽设置账簿，但账目混乱难以查账的
C: 纳税人申报的计税依据明显偏低，但有正当理由的
D: 纳税人发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报的
【解析】（1）选项C：纳税人申报的计税依据明显偏低，又“无正当理由”的，税务机关有权核定其应纳税额；（2）选项D：纳税人发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，“逾期仍不申报”的，税务机关有权核定其应纳税额。
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