增值税专用发票和普通发票主要区别体现在发票的印制要求，发票的内容和发票的联次三个方面。
专用发票和普通发票区别
取得发票的纳税人是否可以依法抵扣购货进项税额。对于增值税专用发票，购货方可以凭抵扣联，依法申报认证抵扣进项税额，而普通发票，购货方不能抵扣进项税额。
1.发票的印制要求不同：根据新的《税收征管法》第二十二条规定：“增值税专用发票由国务院税务主管部门指定的企业印制;其他发票，按照国务院主管部门的规定，分别由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定企业印制。未经前款规定的税务机关指定，不得印制发票。
2.发票的内容不同：增值税专用发票除了具备购买单位、销售单位、商品或者服务的名称、商品或者劳务的数量和计量单位、单价和价款、开票单位、收款人、开票日期等普通发票所具备的内容外，还包括纳税人税务登记号、不含增值税金额、适用税率、应纳增值税额等内容。
3.发票的联次不同：“增值税专用发票有四个联次和七个联次两种，第一联为存根联(用于留存备查)，第二联为发票联(用于购买方记账)，第三联为抵扣联(用作购买方扣税凭证)，第四联为记账联(用于销售方记账)，七联次的其他三联为备用联，分别作为企业出门证、检查和仓库留存用;普通发票一般只有两联，第一联为存根联，第二联为发票联。
增值税专用发票的作用
增值税专用发票是商事凭证，由于实行凭发票购进税款扣税，购货方要向销货方支付增值税，因此也是完税凭证，起到销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明的作用。
一种货物从最初生产到最终消费之间的各个环节可以用增值税专发票连接起来，依据专用发票上注明的税额，每个环节征税，每个环节扣税，让税款从上一个经营环节传递到下一个经营环节，一直到把商品或劳务供应给最终消费者，这样，各环节开具的增值税专用发票上注明的应纳税额之和，就是该商品或劳务的整体税负。因此，体现了增值税普遍征收和公平税负的特征。
收到进项专用发票的账务处理
企业收到进项专用发票时，需要根据实际业务来确认对应的分录，比如一般纳税人取得购进原材料取得专用发票的，其不含税金额计入原材料科目，对应的税额应该计入到应交税费—应交增值税—进项税额科目，其分录为：
借：原材料—XX材料
应交税费—应交增值税—进项税额
贷：银行存款等
