保证金存款是具有结算功能的信用工具，属于质押担保;而非保证金存款是除保证金存款外的储蓄行为，比如居民的一般储蓄存款。
保证金存款和非保证金存款有哪些不同？
1、保证金存款，指的是是金融机构为客户出具具有结算功能的信用工具，或提供资金融通后，按照合约履行相关的义务，而与其约定将一定数量的资金存入特定账户所形成的存款类别。
需要注意的是，在客户违约后，商业银行是有权利直接从账户上划掉款项的，以最大限度地减少银行的损失。
2、所谓的非保证金存款，也就是指除了保证金存款以外的一般储蓄存款行为，其中也包括了我们居民的一般储蓄存款。
需要注意的是，保证金存款与非保证金存款的不同之处不仅仅体现在定义上面，其两者在主体和目的上也有明显的不同。
保证金存款类别
按照保证金担保的对象不同，可以分为下面四种：
1、银行承兑汇票保证金
2、信用证保证金
3、黄金交易保证金
4、远期结售汇保证金四类
其中信用证保证金存款，指的是采用信用证结算方式的企业，为取得信用证而应当按照规定存入银行信用证保证金专户的款项，具体的账务处理如下：
1、企业填写“信用证申请书”，将信用证保证金交存银行时，应根据银行盖章退回的“信用证申请书”回单：
借：其他货币资金—信用证保证金
贷：银行存款
2、企业接到开证行通知，根据供货单位信用证结算凭证及所附发票账单：
借：材料采购/原材料
库存商品
应交税费—应交增值税(进项税额)
贷：其他货币资金—信用证保证金
3、将未用完的信用证保证金存款转回开户银行时：
借：银行存款
贷：其他货币资金—信用证保证金
