代理兑付证券在会计实务中指的是“代理兑付证券”会计科目，属于证券和银行共用的负债类科目，是指证券、银行等企业接受委托代理兑付证券收到的兑付资金。
代理兑付证券是指证券公司接受客户的委托，对客户发行的证券到期以后，按合同规定进行兑付，客户按一定的比例支付给证券公司手续费的行为。一般来说，股票没有固定的到期日，只有债券才会有固定的到期日，所以代理兑付证券业务有时也被称为代理兑付债券业务。
代理兑付证券款借贷方向为借方登记代理兑付的资金，贷方登记收到委托单位的兑付资金，该科目期末贷方余额，反映企业已收到但尚未兑付的代理兑付证券款项。
1、企业兑付记名证券，收到委托单位的兑付资金，借记“银行存款”等科目，贷记“代理兑付证券”科目。收到客户交来的证券，按兑付金额，借记“代理兑付证券”科目，贷记“库存现金”、“银行存款”等科目。兑付无记名证券的，还应通过“代理兑付证券”科目核算。
2、收取代理兑付证券手续费收入，向委托单位单独收取的，按应收或已收取的手续费，借记“应收手续费及佣金”等科目，贷记“手续费及佣金收入”科目。
手续费与兑付款一并汇入的，在收到款项时，应按实际收到的金额，借记“结算备付金”等科目，按应兑付的金额，贷记“代理兑付证券”科目，按事先取得的手续费，贷记“其他应付款——预收代理兑付证券手续费”科目。兑付证券业务完成后确认手续费收入，借记“其他应付款——预收代理兑付证券手续费”科目，贷记“手续费及佣金收入”科目。
