重庆地区个人独资企业针对员工工资薪金个税的计算方法为：应纳税额=（累计预扣预缴应纳税所得额×预扣率-速算扣除数）-累计减免税额-累计已预扣预缴税额。累计预扣预缴应纳税所得额的计算方法为：累计预扣预缴应纳税所得额=累计收入-累计免税收入-累计减除费用-累计专项扣除-累计专项附加扣除-累计依法确定的其他扣除。
个人独资企业针对生产经营所得个税的计征可以分为查账征收和核定征收，查账征收方式下的计算公式为：经营所得个税应纳税额=（全年收入总额-成本、费用以及损失）×适用税率-速算扣除数。核定征收（核定应税所得率）方式下的计算公式为：经营所得个税应纳税额=（收入总额×应税所得率）×适用税率。
