审计调查无论是指导思想还是工作方法都要坚持“全面审计，突出重点”的指导方针，要从审计项目自身实际出发，严谨细致，讲求方法，注重质量、效率和效果，具体要做到以下5点：
1、贯彻好一个重要指导方针
即坚持将“全面审计（调查），突出重点”的重要指导方针贯穿始终。
2、制定和执行好一个审计调查工作方案
这个工作方案要符合项目规模、性质的实际，对审计调查工作既要具有指导性，又要有操作性；因为它对于审计实施能否有成果、有质量具有决定性的影响。
3、组成一个好的结构合理、力量精干的审计调查组
任何工作人才是第一位的，做好审计调查也不例外。调查中如有特殊需要，审计组可从外部聘用专家。
4、要坚持一系列审计调查工作制度
审计调查组应当建立和坚持审计工作中的一系列制度，包括调查座谈、走访，收集资料范围、内容、重点、标准、调查工作日记、记录、底稿等一系列工作制度，其中最重要的是调查组情况碰头分析讨论会议制度。每个成员都定期不定期及时讨论调查发现的新情况、新问题，从而提高调查的效果。这样，才能以制度保障促进审计调查工作的质量、效果。
5、要形成好一个审计调查工作成果
检验审计调查成功与否，从审计工作全过程来讲，要看审计实施方案的指导性、针对性和操作性。
审计调查是审计机关根据经济活动中出现的带有倾向性、普通性的重大问题，通过调查分析，为领导机关加强或改进宏观控制与宏观决策提供有效信息和建议的一种审计方法。
开展审计调查不仅能为宏观决策提供信息和建议，贯彻和完善财经法规，而且有利于审计工作经常化、制度化，提高审计人员政策水平和业务素质。
